Tractul respirator la copiii cu transplant de celule stem: plămânii și nasul au microbiome distincte

Context

Leziunea pulmonară după transplantul de celule stem hematopoietice (HCT) apare prin infecție, toxicitate a chimioterapiei și inflamație aloreactivă — și reprezintă una dintre principalele cauze de mortalitate post-transplant la copii. Lavajul bronhoalveolar (BAL) rămâne standardul de aur pentru evaluarea patobiologiei pulmonare, dar este o procedură invazivă. Există un interes crescând pentru probe neinvazive (nazale, salivare), dar validarea lor ca substitute pentru BAL la pacienții HCT lipsa.

Metodologie

Au fost analizate 206 perechi de probe nazale și BAL de la 160 de pacienți HCT pediatrici și 17 martori sănătoși, înrolați la 28 de spitale de copii din SUA (2016-2025). S-a efectuat secvențiere RNA în bulk pentru ambele tipuri de probe, cu analiza transcriptelor microbiene și umane prin modele multivariabile ajustate pentru vârstă, sex și eșantionare pereche.

Rezultate

Transcriptomele BAL și nazale difereau la 13.698 de gene, 48 de componente celulare și interacțiuni în rețea legate de inflamație, specii reactive de oxigen și imunoetabolism. Corelația BAL-nazal a fost minimă atât în expresia genică (ρ mediu = 0,03) cât și în abundența celulelor cheie (neutrofile, limfocite CD8+).

Microbiomul BAL a prezentat mai puțini bacterii comensuali și mai mulți fungi și virusuri ADN față de probe nazale. ARN-ul bacterian din BAL a fost asociat cu semnalizare imună diminuată, în timp ce ARN-ul bacterian nazal a corelat cu expresie genică inflamatorie. Semnăturile BAL de depleție a microbiomului comensalist, leziune epitelială și disfuncție imună au fost asociate cu deces sau ventilație mecanică prelungită — probele nazale oferind informații prognostice minime. Datele susțin compartimentalizarea alveolară a patobiologiei pulmonare post-HCT.